ILCSoftv01-19-02のインストール方法

[lxplus]

mkdir -p ~/work/ITKTB/Reconstruction/ilcsoft20190821
cd ~/work/ITKTB/Reconstruction/ilcsoft20190821
wget http://atlaspc5.kek.jp/pub/Main/HowToInstallEUTelescope/install_eutelescope.sh
wget http://atlaspc5.kek.jp/pub/Main/HowToInstallEUTelescope/changeRD53Ageo.sh
source install_eutelescope.sh

[local pc]

need to setup CVMFS before install eutelescope

(obsolete)ILCSoftv01-17-05のインストール方法

Reconstructionに必要なEutelescopeをインストールするための手順。

1. EUTelescopeをインストールしたい場所で:

export ILCSOFT=$PWD/ILCSOFT
mkdir -p $ILCSOFT

2. ILCSoft Installer の最新版をチェック:

cd $ILCSOFT
svn co https://svnsrv.desy.de/public/ilctools/ilcinstall/branches/eutel-git ilcinstall_eutel-git

3. Eudaqのバージョンをv1.5.1に変更 -> $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/releases/v01-17-05/release-versions.py

NEW 最近のEUtelescopeとのCompativility がないのでEudaqもtrunkにする必要がある。:

Eudaq_version = "tags/v1.5.1"
EUdaq_version = "trunk"

2016年5月時点では、
Eudaq_version = "tags/v1.5.1"
Eutelescope_version = "tags/v1.0"

4. root のレポジトリのURLが間違っているので、$ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/ilcsoft/root.py

NEW rootのレポジトリが変わったので、urlを以下の様にする。

      self.download.url = 'https://root.cern.ch/download/root_v%s.source.tar.gz' % self.version

root5.34.18のところにリンクを貼る

ln -s /afs/ cern.ch/sw/lcg/app/releases/ROOT/5.34.18/x86_64-scl6-gcc48-opt/root 5.34.18

5. gcc version 4.8をつかう(4.8は4.8.Xの新しいバージョンへのシンボリックリンク):

source /afs/cern.ch/sw/lcg/contrib/gcc/4.8/x86_64-slc6/setup.sh

6. Installationを走らせる:

cd $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git
./ilcsoft-install -i examples/eutelescope/release-standalone.cfg

7. (For 1 hour...) Grab a cup of coffee and chat with the people around you

8. 終わると$ILCSOFT/v01-17-05というファイルができる -> エラーが出ていなければインストール完了！

9. 次回以降にログインした際は、

#####################################
#! /bin/bash
EUTELESCOPEVERSION=trunk
ILCSOFTVERSION=v01-17-05
export TB_ANALYSIS=~/work/ITKTB/Reconstruction/ #directory where you're doing reconstruction
export ILCSOFT=${TB_ANALYSIS}/ilcosft-20150702
export TB_RECDIR=$ILCSOFT/v01-17-05
source $ILCSOFT/$ILCSOFTVERSION/Eutelescope/${EUTELESCOPEVERSION}/build_env.sh
#####################################

こんなものをsetup.shとしておいて、source setup.shとする。

実際にReconstructionを走らせてみる

${ILCSOFT}/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsubにあるjobsub.pyというのが実際にjobを投げるスクリプト。
これらのファイルを持ってきて作業するためのdirectoryを作り、実際に走らせてみる。

1. Reconstructionのための場所を作り、テストビームごとのdirectoryを作る:

• mkdir -p ~/work/ITKTB/Reconstruction/runarea/
• この中で更に、run_cern_2015_jun_itk/などのdirectoryを作る

• サブミットスクリプト jobsub.py
• コンフィグファイル config.cfg
• ギアファイル gear.xml
• ランリスト runlist.csv
• steeringファイル steering-templates/の中にあるファイル

例）4chipのランをreconstructionしてみる↓↓
Reconstructionのための場所として"4chip_example"などのディレクトリを作り...

• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/examples/aconite-4chipLocalの中にあるファイルをコピー
• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/jobsub.pyをコピー
• mkdir -p output/{database,histograms,lcio,logs}

• ./jobsub.py -c ./config.cfg [reco-step] 1085 -csv ./runlist.csv
  ([reco-step] は、 converter, clustering, hitmaker, align, fitter など)

毎回これを書くのが面倒なので run.shというスクリプトを書いている。
run.sh 上の方にある、
DOCONVERTER=1
DOCLUSTERING=0
DOHITMAKER=0
DOALIGN=0
DOFITTER=0
このスイッチでどのステップを走らせるかが選べる。 (全部1にすると全部走る)
./run.sh -c config.cfg -r 1085とかで走らせる。

結果は、output/histogramsにrootファイルとして作られる。clusteringなどでヒットマップが確認できるはず。

4.

5.

-- Hiromi Sawai - 2016-03-15

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[lxplus]

mkdir -p ~/work/ITKTB/Reconstruction/ilcsoft20190821
cd ~/work/ITKTB/Reconstruction/ilcsoft20190821
wget http://atlaspc5.kek.jp/pub/Main/HowToInstallEUTelescope/install_eutelescope.sh
wget http://atlaspc5.kek.jp/pub/Main/HowToInstallEUTelescope/changeRD53Ageo.sh
source install_eutelescope.sh

[local pc]

need to setup CVMFS before install eutelescope

(obsolete)ILCSoftv01-17-05のインストール方法

Reconstructionに必要なEutelescopeをインストールするための手順。

1. EUTelescopeをインストールしたい場所で:

export ILCSOFT=$PWD/ILCSOFT
mkdir -p $ILCSOFT

2. ILCSoft Installer の最新版をチェック:

cd $ILCSOFT
svn co https://svnsrv.desy.de/public/ilctools/ilcinstall/branches/eutel-git ilcinstall_eutel-git

3. Eudaqのバージョンをv1.5.1に変更 -> $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/releases/v01-17-05/release-versions.py

NEW 最近のEUtelescopeとのCompativility がないのでEudaqもtrunkにする必要がある。:

Eudaq_version = "tags/v1.5.1"
EUdaq_version = "trunk"

2016年5月時点では、
Eudaq_version = "tags/v1.5.1"
Eutelescope_version = "tags/v1.0"

4. root のレポジトリのURLが間違っているので、$ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/ilcsoft/root.py

NEW rootのレポジトリが変わったので、urlを以下の様にする。

      self.download.url = 'https://root.cern.ch/download/root_v%s.source.tar.gz' % self.version

root5.34.18のところにリンクを貼る

ln -s /afs/ cern.ch/sw/lcg/app/releases/ROOT/5.34.18/x86_64-scl6-gcc48-opt/root 5.34.18

5. gcc version 4.8をつかう(4.8は4.8.Xの新しいバージョンへのシンボリックリンク):

source /afs/cern.ch/sw/lcg/contrib/gcc/4.8/x86_64-slc6/setup.sh

6. Installationを走らせる:

cd $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git
./ilcsoft-install -i examples/eutelescope/release-standalone.cfg

7. (For 1 hour...) Grab a cup of coffee and chat with the people around you

8. 終わると$ILCSOFT/v01-17-05というファイルができる -> エラーが出ていなければインストール完了！

9. 次回以降にログインした際は、

#####################################
#! /bin/bash
EUTELESCOPEVERSION=trunk
ILCSOFTVERSION=v01-17-05
export TB_ANALYSIS=~/work/ITKTB/Reconstruction/ #directory where you're doing reconstruction
export ILCSOFT=${TB_ANALYSIS}/ilcosft-20150702
export TB_RECDIR=$ILCSOFT/v01-17-05
source $ILCSOFT/$ILCSOFTVERSION/Eutelescope/${EUTELESCOPEVERSION}/build_env.sh
#####################################

こんなものをsetup.shとしておいて、source setup.shとする。

実際にReconstructionを走らせてみる

${ILCSOFT}/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsubにあるjobsub.pyというのが実際にjobを投げるスクリプト。
これらのファイルを持ってきて作業するためのdirectoryを作り、実際に走らせてみる。

1. Reconstructionのための場所を作り、テストビームごとのdirectoryを作る:

• mkdir -p ~/work/ITKTB/Reconstruction/runarea/
• この中で更に、run_cern_2015_jun_itk/などのdirectoryを作る

• サブミットスクリプト jobsub.py
• コンフィグファイル config.cfg
• ギアファイル gear.xml
• ランリスト runlist.csv
• steeringファイル steering-templates/の中にあるファイル

例）4chipのランをreconstructionしてみる↓↓
Reconstructionのための場所として"4chip_example"などのディレクトリを作り...

• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/examples/aconite-4chipLocalの中にあるファイルをコピー
• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/jobsub.pyをコピー
• mkdir -p output/{database,histograms,lcio,logs}

• ./jobsub.py -c ./config.cfg [reco-step] 1085 -csv ./runlist.csv
  ([reco-step] は、 converter, clustering, hitmaker, align, fitter など)

毎回これを書くのが面倒なので run.shというスクリプトを書いている。
run.sh 上の方にある、
DOCONVERTER=1
DOCLUSTERING=0
DOHITMAKER=0
DOALIGN=0
DOFITTER=0
このスイッチでどのステップを走らせるかが選べる。 (全部1にすると全部走る)
./run.sh -c config.cfg -r 1085とかで走らせる。

結果は、output/histogramsにrootファイルとして作られる。clusteringなどでヒットマップが確認できるはず。

4.

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[lxplus]

mkdir -p ~/work/ITKTB/Reconstruction/ilcsoft20190821
cd ~/work/ITKTB/Reconstruction/ilcsoft20190821
wget http://atlaspc5.kek.jp/pub/Main/HowToInstallEUTelescope/install_eutelescope.sh
wget http://atlaspc5.kek.jp/pub/Main/HowToInstallEUTelescope/changeRD53Ageo.sh
source install_eutelescope.sh

need to setup CVMFS before install eutelescope

(obsolete)ILCSoftv01-17-05のインストール方法

Reconstructionに必要なEutelescopeをインストールするための手順。

1. EUTelescopeをインストールしたい場所で:

export ILCSOFT=$PWD/ILCSOFT
mkdir -p $ILCSOFT

2. ILCSoft Installer の最新版をチェック:

cd $ILCSOFT
svn co https://svnsrv.desy.de/public/ilctools/ilcinstall/branches/eutel-git ilcinstall_eutel-git

3. Eudaqのバージョンをv1.5.1に変更 -> $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/releases/v01-17-05/release-versions.py

NEW 最近のEUtelescopeとのCompativility がないのでEudaqもtrunkにする必要がある。:

Eudaq_version = "tags/v1.5.1"
EUdaq_version = "trunk"

2016年5月時点では、
Eudaq_version = "tags/v1.5.1"
Eutelescope_version = "tags/v1.0"

4. root のレポジトリのURLが間違っているので、$ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/ilcsoft/root.py

NEW rootのレポジトリが変わったので、urlを以下の様にする。

      self.download.url = 'https://root.cern.ch/download/root_v%s.source.tar.gz' % self.version

root5.34.18のところにリンクを貼る

ln -s /afs/ cern.ch/sw/lcg/app/releases/ROOT/5.34.18/x86_64-scl6-gcc48-opt/root 5.34.18

5. gcc version 4.8をつかう(4.8は4.8.Xの新しいバージョンへのシンボリックリンク):

source /afs/cern.ch/sw/lcg/contrib/gcc/4.8/x86_64-slc6/setup.sh

6. Installationを走らせる:

cd $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git
./ilcsoft-install -i examples/eutelescope/release-standalone.cfg

7. (For 1 hour...) Grab a cup of coffee and chat with the people around you

8. 終わると$ILCSOFT/v01-17-05というファイルができる -> エラーが出ていなければインストール完了！

9. 次回以降にログインした際は、

#####################################
#! /bin/bash
EUTELESCOPEVERSION=trunk
ILCSOFTVERSION=v01-17-05
export TB_ANALYSIS=~/work/ITKTB/Reconstruction/ #directory where you're doing reconstruction
export ILCSOFT=${TB_ANALYSIS}/ilcosft-20150702
export TB_RECDIR=$ILCSOFT/v01-17-05
source $ILCSOFT/$ILCSOFTVERSION/Eutelescope/${EUTELESCOPEVERSION}/build_env.sh
#####################################

こんなものをsetup.shとしておいて、source setup.shとする。

実際にReconstructionを走らせてみる

${ILCSOFT}/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsubにあるjobsub.pyというのが実際にjobを投げるスクリプト。
これらのファイルを持ってきて作業するためのdirectoryを作り、実際に走らせてみる。

1. Reconstructionのための場所を作り、テストビームごとのdirectoryを作る:

• mkdir -p ~/work/ITKTB/Reconstruction/runarea/
• この中で更に、run_cern_2015_jun_itk/などのdirectoryを作る

• サブミットスクリプト jobsub.py
• コンフィグファイル config.cfg
• ギアファイル gear.xml
• ランリスト runlist.csv
• steeringファイル steering-templates/の中にあるファイル

例）4chipのランをreconstructionしてみる↓↓
Reconstructionのための場所として"4chip_example"などのディレクトリを作り...

• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/examples/aconite-4chipLocalの中にあるファイルをコピー
• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/jobsub.pyをコピー
• mkdir -p output/{database,histograms,lcio,logs}

• ./jobsub.py -c ./config.cfg [reco-step] 1085 -csv ./runlist.csv
  ([reco-step] は、 converter, clustering, hitmaker, align, fitter など)

毎回これを書くのが面倒なので run.shというスクリプトを書いている。
run.sh 上の方にある、
DOCONVERTER=1
DOCLUSTERING=0
DOHITMAKER=0
DOALIGN=0
DOFITTER=0
このスイッチでどのステップを走らせるかが選べる。 (全部1にすると全部走る)
./run.sh -c config.cfg -r 1085とかで走らせる。

結果は、output/histogramsにrootファイルとして作られる。clusteringなどでヒットマップが確認できるはず。

4.

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1. EUTelescopeをインストールしたい場所で:

export ILCSOFT=$PWD/ILCSOFT
mkdir -p $ILCSOFT

2. ILCSoft Installer の最新版をチェック:

cd $ILCSOFT
svn co https://svnsrv.desy.de/public/ilctools/ilcinstall/branches/eutel-git ilcinstall_eutel-git

3. Eudaqのバージョンをv1.5.1に変更 -> $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/releases/v01-17-05/release-versions.py

NEW 最近のEUtelescopeとのCompativility がないのでEudaqもtrunkにする必要がある。:

Eudaq_version = "tags/v1.5.1"
EUdaq_version = "trunk"

2016年5月時点では、
Eudaq_version = "tags/v1.5.1"
Eutelescope_version = "tags/v1.0"

4. root のレポジトリのURLが間違っているので、$ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/ilcsoft/root.py

NEW rootのレポジトリが変わったので、urlを以下の様にする。

      self.download.url = 'https://root.cern.ch/download/root_v%s.source.tar.gz' % self.version

root5.34.18のところにリンクを貼る

ln -s /afs/ cern.ch/sw/lcg/app/releases/ROOT/5.34.18/x86_64-scl6-gcc48-opt/root 5.34.18

5. gcc version 4.8をつかう(4.8は4.8.Xの新しいバージョンへのシンボリックリンク):

source /afs/cern.ch/sw/lcg/contrib/gcc/4.8/x86_64-slc6/setup.sh

6. Installationを走らせる:

cd $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git
./ilcsoft-install -i examples/eutelescope/release-standalone.cfg

7. (For 1 hour...) Grab a cup of coffee and chat with the people around you

8. 終わると$ILCSOFT/v01-17-05というファイルができる -> エラーが出ていなければインストール完了！

9. 次回以降にログインした際は、

#####################################
#! /bin/bash
EUTELESCOPEVERSION=trunk
ILCSOFTVERSION=v01-17-05
export TB_ANALYSIS=~/work/ITKTB/Reconstruction/ #directory where you're doing reconstruction
export ILCSOFT=${TB_ANALYSIS}/ilcosft-20150702
export TB_RECDIR=$ILCSOFT/v01-17-05
source $ILCSOFT/$ILCSOFTVERSION/Eutelescope/${EUTELESCOPEVERSION}/build_env.sh
#####################################

こんなものをsetup.shとしておいて、source setup.shとする。

実際にReconstructionを走らせてみる

${ILCSOFT}/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsubにあるjobsub.pyというのが実際にjobを投げるスクリプト。
これらのファイルを持ってきて作業するためのdirectoryを作り、実際に走らせてみる。

1. Reconstructionのための場所を作り、テストビームごとのdirectoryを作る:

• mkdir -p ~/work/ITKTB/Reconstruction/runarea/
• この中で更に、run_cern_2015_jun_itk/などのdirectoryを作る

• サブミットスクリプト jobsub.py
• コンフィグファイル config.cfg
• ギアファイル gear.xml
• ランリスト runlist.csv
• steeringファイル steering-templates/の中にあるファイル

例）4chipのランをreconstructionしてみる↓↓
Reconstructionのための場所として"4chip_example"などのディレクトリを作り...

• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/examples/aconite-4chipLocalの中にあるファイルをコピー
• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/jobsub.pyをコピー
• mkdir -p output/{database,histograms,lcio,logs}

• ./jobsub.py -c ./config.cfg [reco-step] 1085 -csv ./runlist.csv
  ([reco-step] は、 converter, clustering, hitmaker, align, fitter など)

毎回これを書くのが面倒なので run.shというスクリプトを書いている。
run.sh 上の方にある、
DOCONVERTER=1
DOCLUSTERING=0
DOHITMAKER=0
DOALIGN=0
DOFITTER=0
このスイッチでどのステップを走らせるかが選べる。 (全部1にすると全部走る)
./run.sh -c config.cfg -r 1085とかで走らせる。

結果は、output/histogramsにrootファイルとして作られる。clusteringなどでヒットマップが確認できるはず。

4.

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ILCSoftv01-17-05のインストール方法

Reconstructionに必要なEutelescopeをインストールするための手順。

1. EUTelescopeをインストールしたい場所で:

export ILCSOFT=$PWD/ILCSOFT
mkdir -p $ILCSOFT

2. ILCSoft Installer の最新版をチェック:

cd $ILCSOFT
svn co https://svnsrv.desy.de/public/ilctools/ilcinstall/branches/eutel-git ilcinstall_eutel-git

3. Eudaqのバージョンをv1.5.1に変更 -> $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/releases/v01-17-05/release-versions.py

NEW 最近のEUtelescopeとのCompativility がないのでEudaqもtrunkにする必要がある。:

Eudaq_version = "tags/v1.5.1"
EUdaq_version = "trunk"

2016年5月時点では、
Eudaq_version = "tags/v1.5.1"
Eutelescope_version = "tags/v1.0"

4. root のレポジトリのURLが間違っているので、$ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/ilcsoft/root.py

NEW rootのレポジトリが変わったので、urlを以下の様にする。

      self.download.url = 'https://root.cern.ch/download/root_v%s.source.tar.gz' % self.version

root5.34.18のところにリンクを貼る

ln -s /afs/ cern.ch/sw/lcg/app/releases/ROOT/5.34.18/x86_64-scl6-gcc48-opt/root 5.34.18

5. gcc version 4.8をつかう(4.8は4.8.Xの新しいバージョンへのシンボリックリンク):

source /afs/cern.ch/sw/lcg/contrib/gcc/4.8/x86_64-slc6/setup.sh

6. Installationを走らせる:

cd $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git
./ilcsoft-install -i examples/eutelescope/release-standalone.cfg

7. (For 1 hour...) Grab a cup of coffee and chat with the people around you

8. 終わると$ILCSOFT/v01-17-05というファイルができる -> エラーが出ていなければインストール完了！

9. 次回以降にログインした際は、

#####################################
#! /bin/bash
EUTELESCOPEVERSION=trunk
ILCSOFTVERSION=v01-17-05
export TB_ANALYSIS=~/work/ITKTB/Reconstruction/ #directory where you're doing reconstruction
export ILCSOFT=${TB_ANALYSIS}/ilcosft-20150702
export TB_RECDIR=$ILCSOFT/v01-17-05
source $ILCSOFT/$ILCSOFTVERSION/Eutelescope/${EUTELESCOPEVERSION}/build_env.sh
#####################################

こんなものをsetup.shとしておいて、source setup.shとする。

実際にReconstructionを走らせてみる

${ILCSOFT}/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsubにあるjobsub.pyというのが実際にjobを投げるスクリプト。
これらのファイルを持ってきて作業するためのdirectoryを作り、実際に走らせてみる。

1. Reconstructionのための場所を作り、テストビームごとのdirectoryを作る:

• mkdir -p ~/work/ITKTB/Reconstruction/runarea/
• この中で更に、run_cern_2015_jun_itk/などのdirectoryを作る

• サブミットスクリプト jobsub.py
• コンフィグファイル config.cfg
• ギアファイル gear.xml
• ランリスト runlist.csv
• steeringファイル steering-templates/の中にあるファイル

例）4chipのランをreconstructionしてみる↓↓
Reconstructionのための場所として"4chip_example"などのディレクトリを作り...

• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/examples/aconite-4chipLocalの中にあるファイルをコピー
• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/jobsub.pyをコピー
• mkdir -p output/{database,histograms,lcio,logs}

• ./jobsub.py -c ./config.cfg [reco-step] 1085 -csv ./runlist.csv
  ([reco-step] は、 converter, clustering, hitmaker, align, fitter など)

毎回これを書くのが面倒なので run.shというスクリプトを書いている。
run.sh 上の方にある、
DOCONVERTER=1
DOCLUSTERING=0
DOHITMAKER=0
DOALIGN=0
DOFITTER=0
このスイッチでどのステップを走らせるかが選べる。 (全部1にすると全部走る)
./run.sh -c config.cfg -r 1085とかで走らせる。

結果は、output/histogramsにrootファイルとして作られる。clusteringなどでヒットマップが確認できるはず。

4.

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ILCSoftv01-17-05のインストール方法

Reconstructionに必要なEutelescopeをインストールするための手順。

1. EUTelescopeをインストールしたい場所で:

export ILCSOFT=$PWD/ILCSOFT
mkdir -p $ILCSOFT

2. ILCSoft Installer の最新版をチェック:

cd $ILCSOFT
svn co https://svnsrv.desy.de/public/ilctools/ilcinstall/branches/eutel-git ilcinstall_eutel-git

3. Eudaqのバージョンをv1.5.1に変更 -> $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/releases/v01-17-05/release-versions.py

Eudaq_version = "tags/v1.5.1"

      self.download.url = 'https://root.cern.ch/download/root_v%s.source.tar.gz' % self.version

source /afs/cern.ch/sw/lcg/contrib/gcc/4.8/x86_64-slc6/setup.sh

6. Installationを走らせる:

cd $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git
./ilcsoft-install -i examples/eutelescope/release-standalone.cfg

9. 次回以降にログインした際は、

#####################################
#! /bin/bash
EUTELESCOPEVERSION=trunk
ILCSOFTVERSION=v01-17-05
export TB_ANALYSIS=~/work/ITKTB/Reconstruction/ #directory where you're doing reconstruction
export ILCSOFT=${TB_ANALYSIS}/ilcosft-20150702
export TB_RECDIR=$ILCSOFT/v01-17-05
source $ILCSOFT/$ILCSOFTVERSION/Eutelescope/${EUTELESCOPEVERSION}/build_env.sh
#####################################

こんなものをsetup.shとしておいて、source setup.shとする。

実際にReconstructionを走らせてみる

${ILCSOFT}/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsubにあるjobsub.pyというのが実際にjobを投げるスクリプト。
これらのファイルを持ってきて作業するためのdirectoryを作り、実際に走らせてみる。

1. Reconstructionのための場所を作り、テストビームごとのdirectoryを作る:

• mkdir -p ~/work/ITKTB/Reconstruction/runarea/
• この中で更に、run_cern_2015_jun_itk/などのdirectoryを作る

• サブミットスクリプト jobsub.py
• コンフィグファイル config.cfg
• ギアファイル gear.xml
• ランリスト runlist.csv
• steeringファイル steering-templates/の中にあるファイル

例）4chipのランをreconstructionしてみる↓↓
Reconstructionのための場所として"4chip_example"などのディレクトリを作り...

• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/examples/aconite-4chipLocalの中にあるファイルをコピー
• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/jobsub.pyをコピー
• mkdir -p output/{database,histograms,lcio,logs}

• ./jobsub.py -c ./config.cfg [reco-step] 1085 -csv ./runlist.csv
  ([reco-step] は、 converter, clustering, hitmaker, align, fitter など)

毎回これを書くのが面倒なので run.shというスクリプトを書いている。
run.sh 上の方にある、
DOCONVERTER=1
DOCLUSTERING=0
DOHITMAKER=0
DOALIGN=0
DOFITTER=0
このスイッチでどのステップを走らせるかが選べる。 (全部1にすると全部走る)
./run.sh -c config.cfg -r 1085とかで走らせる。

結果は、output/histogramsにrootファイルとして作られる。clusteringなどでヒットマップが確認できるはず。

4.

5.

-- Hiromi Sawai - 2016-03-15

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ILCSoftv01-17-05のインストール方法

Reconstructionに必要なEutelescopeをインストールするための手順。

1. EUTelescopeをインストールしたい場所で:

export ILCSOFT=$PWD/ILCSOFT
mkdir -p $ILCSOFT

2. ILCSoft Installer の最新版をチェック:

cd $ILCSOFT
svn co https://svnsrv.desy.de/public/ilctools/ilcinstall/branches/eutel-git ilcinstall_eutel-git

3. Eudaqのバージョンをv1.5.1に変更 -> $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/releases/v01-17-05/release-versions.py

Eudaq_version = "tags/v1.5.1"
EUdaq_version = "trunk" 

2016年5月時点では、
Eudaq_version = "tags/v1.5.1"
Eutelescope_version = "tags/v1.0"

4. root のレポジトリのURLが間違っているので、$ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/ilcsoft/root.py

NEW rootのレポジトリが変わったので、urlを以下の様にする。

      self.download.url = 'https://root.cern.ch/download/root_v%s.source.tar.gz' % self.version

root5.34.18のところにリンクを貼る

ln -s /afs/ cern.ch/sw/lcg/app/releases/ROOT/5.34.18/x86_64-scl6-gcc48-opt/root 5.34.18

5. gcc version 4.8をつかう(4.8は4.8.Xの新しいバージョンへのシンボリックリンク):

source /afs/cern.ch/sw/lcg/contrib/gcc/4.8/x86_64-slc6/setup.sh

6. Installationを走らせる:

cd $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git
./ilcsoft-install -i examples/eutelescope/release-standalone.cfg

7. (For 1 hour...) Grab a cup of coffee and chat with the people around you

8. 終わると$ILCSOFT/v01-17-05というファイルができる -> エラーが出ていなければインストール完了！

9. 次回以降にログインした際は、

#####################################
#! /bin/bash
EUTELESCOPEVERSION=trunk
ILCSOFTVERSION=v01-17-05
export TB_ANALYSIS=~/work/ITKTB/Reconstruction/ #directory where you're doing reconstruction
export ILCSOFT=${TB_ANALYSIS}/ilcosft-20150702
export TB_RECDIR=$ILCSOFT/v01-17-05
source $ILCSOFT/$ILCSOFTVERSION/Eutelescope/${EUTELESCOPEVERSION}/build_env.sh
#####################################

こんなものをsetup.shとしておいて、source setup.shとする。

実際にReconstructionを走らせてみる

${ILCSOFT}/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsubにあるjobsub.pyというのが実際にjobを投げるスクリプト。
これらのファイルを持ってきて作業するためのdirectoryを作り、実際に走らせてみる。

1. Reconstructionのための場所を作り、テストビームごとのdirectoryを作る:

• mkdir -p ~/work/ITKTB/Reconstruction/runarea/
• この中で更に、run_cern_2015_jun_itk/などのdirectoryを作る

• サブミットスクリプト jobsub.py
• コンフィグファイル config.cfg
• ギアファイル gear.xml
• ランリスト runlist.csv
• steeringファイル steering-templates/の中にあるファイル

例）4chipのランをreconstructionしてみる↓↓
Reconstructionのための場所として"4chip_example"などのディレクトリを作り...

• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/examples/aconite-4chipLocalの中にあるファイルをコピー
• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/jobsub.pyをコピー
• mkdir -p output/{database,histograms,lcio,logs}

• ./jobsub.py -c ./config.cfg [reco-step] 1085 -csv ./runlist.csv
  ([reco-step] は、 converter, clustering, hitmaker, align, fitter など)

毎回これを書くのが面倒なので run.shというスクリプトを書いている。
run.sh 上の方にある、
DOCONVERTER=1
DOCLUSTERING=0
DOHITMAKER=0
DOALIGN=0
DOFITTER=0
このスイッチでどのステップを走らせるかが選べる。 (全部1にすると全部走る)
./run.sh -c config.cfg -r 1085とかで走らせる。

結果は、output/histogramsにrootファイルとして作られる。clusteringなどでヒットマップが確認できるはず。

4.

5.

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Reconstructionに必要なEutelescopeをインストールするための手順。

https://svnsrv.desy.de/public/ilctools/ilcinstall/branches/eutel-git

3. Eudaqのバージョンをv1.5.1に変更 -> $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/releases/v01-17-05/release-versions.py

9. 次回以降にログインした際は、

#####################################
#! /bin/bash
EUTELESCOPEVERSION=trunk
ILCSOFTVERSION=v01-17-05
export TB_ANALYSIS=~/work/ITKTB/Reconstruction/ #directory where you're doing reconstruction
export ILCSOFT=${TB_ANALYSIS}/ilcosft-20150702
export TB_RECDIR=$ILCSOFT/v01-17-05
source $ILCSOFT/$ILCSOFTVERSION/Eutelescope/${EUTELESCOPEVERSION}/build_env.sh
#####################################

実際にReconstructionを走らせてみる

${ILCSOFT}/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsubにあるjobsub.pyというのが実際にjobを投げるスクリプト。
これらのファイルを持ってきて作業するためのdirectoryを作り、実際に走らせてみる。

1. Reconstructionのための場所を作り、テストビームごとのdirectoryを作る:

• この中で更に、run_cern_2015_jun_itk/などのdirectoryを作る

• サブミットスクリプト jobsub.py
• コンフィグファイル config.cfg
• ギアファイル gear.xml
• ランリスト runlist.csv
• steeringファイル steering-templates/の中にあるファイル

例）4chipのランをreconstructionしてみる↓↓
Reconstructionのための場所として"4chip_example"などのディレクトリを作り...

• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/examples/aconite-4chipLocalの中にあるファイルをコピー
• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/jobsub.pyをコピー

4.

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Reconstructionに必要なEutelescopeをインストールするための手順。

8. 終わると$ILCSOFT/v01-17-05というファイルができる -> エラーが出ていなければインストール完了！

9. 次回以降にログインした際は、

#####################################
#! /bin/bash
EUTELESCOPEVERSION=trunk
ILCSOFTVERSION=v01-17-05
export TB_ANALYSIS=~/work/ITKTB/Reconstruction/ #directory where you're doing reconstruction
export ILCSOFT=${TB_ANALYSIS}/ilcosft-20150702
export TB_RECDIR=$ILCSOFT/v01-17-05
source $ILCSOFT/$ILCSOFTVERSION/Eutelescope/${EUTELESCOPEVERSION}/build_env.sh
#####################################

こんなものをsetup.shとしておいて、source setup.shとする。

実際にReconstructionを走らせてみる

${ILCSOFT}/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsubにあるjobsub.pyというのが実際にjobを投げるスクリプト。
これらのファイルを持ってきて作業するためのdirectoryを作り、実際に走らせてみる。

1. Reconstructionのための場所を作り、テストビームごとのdirectoryを作る:

• mkdir -p ~/work/ITKTB/Reconstruction/runarea/
• この中で更に、run_cern_2015_jun_itk/などのdirectoryを作る

• サブミットスクリプト jobsub.py
• コンフィグファイル config.cfg
• ギアファイル gear.xml
• ランリスト runlist.csv
• steeringファイル steering-templates/の中にあるファイル

例）4chipのランをreconstructionしてみる↓↓
Reconstructionのための場所として"4chip_example"などのディレクトリを作り...

• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/examples/aconite-4chipLocalの中にあるファイルをコピー
• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/jobsub.pyをコピー
• mkdir -p output/{database,histograms,lcio,logs}

• ./jobsub.py -c ./config.cfg [reco-step] 1085 -csv ./runlist.csv
  ([reco-step] は、 converter, clustering, hitmaker, align, fitter など)

毎回これを書くのが面倒なので run.shというスクリプトを書いている。
run.sh 上の方にある、
DOCONVERTER=1
DOCLUSTERING=0
DOHITMAKER=0
DOALIGN=0
DOFITTER=0
このスイッチでどのステップを走らせるかが選べる。 (全部1にすると全部走る)
./run.sh -c config.cfg -r 1085とかで走らせる。

結果は、output/histogramsにrootファイルとして作られる。clusteringなどでヒットマップが確認できるはず。

4.

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Reconstructionに必要なEutelescopeをインストールするための手順。

1. EUTelescopeをインストールしたい場所で:

• export ILCSOFT=$PWD/ILCSOFT
• mkdir -p $ILCSOFT

• cd $ILCSOFT
• svn co https://svnsrv.desy.de/public/ilctools/ilcinstall/branches/eutel-git ilcinstall_eutel-git

• Eudaq_version = "tags/v1.5.1”

4. root のレポジトリのURLが間違っているので、$ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/ilcsoft/root.py
"http://"で始まっているのを"https://"に変える

5. gcc version 4.8をつかう(4.8は4.8.Xの新しいバージョンへのシンボリックリンク):

• source /afs/cern.ch/sw/lcg/contrib/gcc/4.8/x86_64-slc6/setup.sh

• cd $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git
• ./ilcsoft-install -i examples/eutelescope/release-standalone.cfg

8. 終わると$ILCSOFT/v01-17-05というファイルができる -> エラーが出ていなければインストール完了！

9. 次回以降にログインした際は、

#####################################
#! /bin/bash
EUTELESCOPEVERSION=trunk
ILCSOFTVERSION=v01-17-05
export TB_ANALYSIS=~/work/ITKTB/Reconstruction/ #directory where you're doing reconstruction
export ILCSOFT=${TB_ANALYSIS}/ilcosft-20150702
export TB_RECDIR=$ILCSOFT/v01-17-05
source $ILCSOFT/$ILCSOFTVERSION/Eutelescope/${EUTELESCOPEVERSION}/build_env.sh
#####################################

こんなものをsetup.shとしておいて、source setup.shとする。

実際にReconstructionを走らせてみる

${ILCSOFT}/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsubにあるjobsub.pyというのが実際にjobを投げるスクリプト。
これらのファイルを持ってきて作業するためのdirectoryを作り、実際に走らせてみる。

1. Reconstructionのための場所を作り、テストビームごとのdirectoryを作る:

• mkdir -p ~/work/ITKTB/Reconstruction/runarea/
• この中で更に、run_cern_2015_jun_itk/などのdirectoryを作る

• サブミットスクリプト jobsub.py
• コンフィグファイル config.cfg
• ギアファイル gear.xml
• ランリスト runlist.csv
• steeringファイル steering-templates/の中にあるファイル

例）4chipのランをreconstructionしてみる↓↓
Reconstructionのための場所として"4chip_example"などのディレクトリを作り...

• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/examples/aconite-4chipLocalの中にあるファイルをコピー
• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/jobsub.pyをコピー
• mkdir -p output/{database,histograms,lcio,logs}

結果は、output/histogramsにrootファイルとして作られる。clusteringなどでヒットマップが確認できるはず。

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Reconstructionに必要なEutelescopeをインストールするための手順。

1. EUTelescopeをインストールしたい場所で:

5. gcc version 4.8をつかう(4.8は4.8.Xの新しいバージョンへのシンボリックリンク):

8. 終わると$ILCSOFT/v01-17-05というファイルができる -> エラーが出ていなければインストール完了！

9. 次回以降にログインした際は、

#####################################
#! /bin/bash
EUTELESCOPEVERSION=trunk
ILCSOFTVERSION=v01-17-05
export TB_ANALYSIS=~/work/ITKTB/Reconstruction/ #directory where you're doing reconstruction
export ILCSOFT=${TB_ANALYSIS}/ilcosft-20150702
export TB_RECDIR=$ILCSOFT/v01-17-05
source $ILCSOFT/$ILCSOFTVERSION/Eutelescope/${EUTELESCOPEVERSION}/build_env.sh
#####################################

実際にReconstructionを走らせてみる

${ILCSOFT}/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsubにあるjobsub.pyというのが実際にjobを投げるスクリプト。
これらのファイルを持ってきて作業するためのdirectoryを作り、実際に走らせてみる。

1. Reconstructionのための場所を作り、テストビームごとのdirectoryを作る:

• この中で更に、run_cern_2015_jun_itk/などのdirectoryを作る

• サブミットスクリプト jobsub.py
• コンフィグファイル config.cfg
• ギアファイル gear.xml
• ランリスト runlist.csv
• steeringファイル steering-templates/の中にあるファイル

例）4chipのランをreconstructionしてみる↓↓
Reconstructionのための場所として"4chip_example"などのディレクトリを作り...

• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/examples/aconite-4chipLocalの中にあるファイルをコピー
• $ILCSOFT/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsub/jobsub.pyをコピー

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Reconstructionに必要なEutelescopeをインストールするための手順。

1. EUTelescopeをインストールしたい場所で:

• export ILCSOFT=$PWD/ILCSOFT
• mkdir -p $ILCSOFT

• cd $ILCSOFT
• svn co https://svnsrv.desy.de/public/ilctools/ilcinstall/branches/eutel-git ilcinstall_eutel-git

• Eudaq_version = "tags/v1.5.1”

4. root のレポジトリのURLが間違っているので、$ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/ilcsoft/root.py
"http://"で始まっているのを"https://"に変える

5. gcc version 4.8をつかう(4.8は4.8.Xの新しいバージョンへのシンボリックリンク):

• source /afs/cern.ch/sw/lcg/releases/gcc/4.8/x86_64-slc6/setup.sh

• cd $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git
• ./ilcsoft-install -i examples/eutelescope/release-standalone.cfg

8. 終わると$ILCSOFT/v01-17-05というファイルができる -> エラーが出ていなければインストール完了！

9. 次回以降にログインした際は、

#####################################
#! /bin/bash
EUTELESCOPEVERSION=trunk
ILCSOFTVERSION=v01-17-05
export TB_ANALYSIS=~/work/ITKTB/Reconstruction/ #directory where you're doing reconstruction
export ILCSOFT=${TB_ANALYSIS}/ilcosft-20150702
export TB_RECDIR=$ILCSOFT/v01-17-05
source $ILCSOFT/$ILCSOFTVERSION/Eutelescope/${EUTELESCOPEVERSION}/build_env.sh
#####################################

こんなものをsetup.shとしておいて、source setup.shとする。

実際にReconstructionを走らせてみる

${ILCSOFT}/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsubにあるjobsub.pyというのが実際にjobを投げるスクリプト。
これらのファイルを持ってきて作業するためのdirectoryを作り、実際に走らせてみる。

1. Reconstructionのための場所を作り、テストビームごとのdirectoryを作る:

• mkdir -p ~/work/ITKTB/Reconstruction/runarea/
• この中で更に、run_cern_2015_jun_itk/などのdirectoryを作る

• サブミットスクリプト jobsub.py
• コンフィグファイル config.cfg
• ギアファイル gear.xml
• ランリスト runlist.csv
• steeringファイル steering-templates/の中にあるファイル

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Reconstructionに必要なEutelescopeをインストールするための手順。

1. EUTelescopeをインストールしたい場所で:

• export ILCSOFT=$PWD/ILCSOFT
• mkdir -p $ILCSOFT

• cd $ILCSOFT
• svn co https://svnsrv.desy.de/public/ilctools/ilcinstall/branches/eutel-git ilcinstall_eutel-git

• Eudaq_version = "tags/v1.5.1”

4. root のレポジトリのURLが間違っているので、$ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/ilcsoft/root.py
"http://"で始まっているのを"https://"に変える

• cd $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git
• ./ilcsoft-install -i examples/eutelescope/release-standalone.cfg

8. 終わると$ILCSOFT/v01-17-05というファイルができる -> エラーが出ていなければインストール完了！

9. 次回以降にログインした際は、

#####################################
#! /bin/bash
EUTELESCOPEVERSION=trunk
ILCSOFTVERSION=v01-17-05
export TB_ANALYSIS=~/work/ITKTB/Reconstruction/ #directory where you're doing reconstruction
export ILCSOFT=${TB_ANALYSIS}/ilcosft-20150702
export TB_RECDIR=$ILCSOFT/v01-17-05
source $ILCSOFT/$ILCSOFTVERSION/Eutelescope/${EUTELESCOPEVERSION}/build_env.sh
#####################################

こんなものをsetup.shとしておいて、source setup.shとする。

実際にReconstructionを走らせてみる

${ILCSOFT}/v01-17-05/Eutelescope/trunk/jobsubにあるjobsub.pyというのが実際にjobを投げるスクリプト。
これらのファイルを持ってきて作業するためのdirectoryを作り、実際に走らせてみる。

• mkdir -p ~/work/ITKTB/Reconstruction/runarea/
• この中で更に、run_cern_2015_jun_itk/などのdirectoryを作る

• サブミットスクリプト jobsub.py
• コンフィグファイル config.cfg
• ギアファイル gear.xml
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• export ILCSOFT=$PWD/ILCSOFT
• mkdir -p $ILCSOFT

• cd $ILCSOFT
• svn co https://svnsrv.desy.de/public/ilctools/ilcinstall/branches/eutel-git ilcinstall_eutel-git

• Eudaq_version = "tags/v1.5.1”

4. root のレポジトリのURLが間違っているので、$ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/ilcsoft/root.py
"http://"で始まっているのを"https://"に変える

5. gcc version 4.8.1をつかう:

• source /afs/cern.ch/sw/lcg/releases/gcc/4.8.1/x86_64-slc6/setup.sh

• cd $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git
• ./ilcsoft-install -i examples/eutelescope/release-standalone.cfg

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1. EUTelescopeをインストールしたい場所で:

• export ILCSOFT=$PWD/ILCSOFT
• mkdir -p $ILCSOFT

• cd $ILCSOFT
• svn co https://svnsrv.desy.de/public/ilctools/ilcinstall/branches/eutel-git ilcinstall_eutel-git

• Eudaq_version = "tags/v1.5.1”

4. root のレポジトリのURLが間違っているので、$ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git/ilcsoft/root.py
"http://"で始まっているのを"https://"に変える

5. gcc version 4.8.1をつかう:

• source /afs/cern.ch/sw/lcg/releases/gcc/4.8.1/x86_64-slc6/setup.sh

• cd $ILCSOFT/ilcinstall_eutel-git
• ./ilcsoft-install -i examples/eutelescope/release-standalone.cfg

(1 hour...)

8. 終わると$ILCSOFT/v01-17-05というファイルができる -> エラーが出ていなければインストール完了！

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